Cada registro de índice en InnoDB contiene un encabezado de seis bytes. El encabezado se emplea para enlazar juntos registros consecutivos, y también en el bloqueo a nivel de fila.

Los registros en el índice agrupado contienen campos para todas las columnas definidas por el usuario. Adicionalmente, hay un campo de seis bytes para el IDentificador de transacción y un campo de siete bytes para el roll pointer.

Si no se definió una clave primaria para la tabla, cada registro de índice agrupado contiene también un campo de IDentificación de fila de seis bytes.

Cada registro de índice secundario contiene también todos los campos definidos para la clave del índice agrupado.

Un registro contiene además un puntero a cada campo del mismo. Si la longitud total de los campos en un registro es menos de 128 bytes, el puntero medirá un byte, de lo contrario, tendrá dos bytes de longitud. La matriz de estos punteros se conoce como el directorio de registros. El área a donde señalan estos punteros se denomina la parte de datos del registro.

Internamente, InnoDB almacena las columnas de caracteres de longitud fija (como CHAR(10)) en un formato de longitud fija. InnoDB trunca los espacios sobrantes de las columnas VARCHAR. Nótese que MySQL puede convertir internamente columnas CHAR a VARCHAR. Consulte Sección 13.1.5.1, “Cambios tácitos en la especificación de columnas”.

Un valor NULL SQL reserva 1 o 2 bytes en el directorio de registros. No reservará ningún byte en la parte de datos del registro si se lo almacena en una columna de longitud variable. En una columna de longitud fija, reservará en la parte de datos la longitud asignada a dicha columna. La razón por la que se reserva este espacio fijo a pesar de tratarse de un valor NULL, es que en el futuro se podrá insertar en su lugar un valor no-NULL sin provocar la fragmentación de la página de índice.